IFI16

IFI16
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Human UniProt search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	2OQ0, 3B6Y, 3RLN, 3RLO, 3RNU, 4QGU
معرفات
أسماء بديلة	IFI16, IFNGIP1, PYHIN2, interferon gamma inducible protein 16
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 147586 MGI: MGI:3695276 HomoloGene: 115929 GeneCards: 3428
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ‏GO:0001078، ‏GO:0001214، ‏GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • identical protein binding; • double-stranded DNA binding; • ‏GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • ربط دي إن إي; • transcription factor binding; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • RNA binding;
مكونات خلوية	• نوية; • بلازم نووي; • نواة; • غشاء; • nuclear speck; • سيتوبلازم; • عصارة خلوية;
عمليات حيوية	• positive regulation of type I interferon production; • ‏GO:0032737 positive regulation of cytokine production; • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; • cellular response to glucose starvation; • نسخ الدنا; • negative regulation of viral genome replication; • negative regulation of innate immune response; • monocyte differentiation; • cellular response to ionizing radiation; • negative regulation of DNA binding; • regulation of autophagy; • myeloid cell differentiation; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • ‏GO:0097285 استماتة; • تكون الدم; • activation of cysteine-type endopeptidase activity; • التهام ذاتي; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity; • ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of interleukin-1 beta production; • ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا; • regulation of gene expression, epigenetic; • تكاثر خلوي; • ‏GO:0003257، ‏GO:0010735، ‏GO:1901228، ‏GO:1900622، ‏GO:1904488 ضبط زيادي للنسخ انطلاقا من محفز بوليميراز الرنا الثاني; • activation of innate immune response; • immune system process; • inflammatory response; • ‏GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • مناعة فطرية; • defense response to virus; • cellular response to interferon-beta;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ; ; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q16666; X6RHM1
	n/a
	‏NM_005531، ‏NM_001364867، ‏NM_001376587، ‏NM_001376588، ‏NM_001376589، ‏NM_001376591، ‏NM_001376592، ‏XM_047419399، ‏XM_047419406، ‏XM_047419411، ‏XM_047419413، ‏XR_007059344 NM_001206567، ‏NM_005531، ‏NM_001364867، ‏NM_001376587، ‏NM_001376588، ‏NM_001376589، ‏NM_001376591، ‏NM_001376592، ‏XM_047419399، ‏XM_047419406، ‏XM_047419411، ‏XM_047419413، ‏XR_007059344
	‏NM_001177349، ‏NM_001177350، ‏XM_011238850، ‏XM_011238851، ‏XM_011238852، ‏NM_001368798، ‏NM_001368799، ‏NR_160907، ‏NR_160908، ‏XM_030255718، ‏XM_036152616 NM_001033384، ‏NM_001177349، ‏NM_001177350، ‏XM_011238850، ‏XM_011238851، ‏XM_011238852، ‏NM_001368798، ‏NM_001368799، ‏NR_160907، ‏NR_160908، ‏XM_030255718، ‏XM_036152616
	‏NP_005522، ‏XP_016856639، ‏NP_001351796، ‏NP_001363516، ‏NP_001363517، ‏NP_001363518، ‏NP_001363520، ‏NP_001363521 NP_001193496، ‏NP_005522، ‏XP_016856639، ‏NP_001351796، ‏NP_001363516، ‏NP_001363517، ‏NP_001363518، ‏NP_001363520، ‏NP_001363521
	n/a
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

IFI16‏ (Interferon gamma inducible protein 16) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين IFI16 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

يُشفِّر هذا الجين أحدَ أفراد عائلة السيتوكينات HIN-200 (مستضدات نووية مُستحثة بالإنترفيرون المُكوِّن للدم مع 200 تكرار حمض أميني). يحتوي البروتين المُشفَّر على مجالاتٍ تُشارك في ربط الحمض النووي، وتنظيم النسخ، وتفاعلات البروتين-البروتين. يتمركز البروتين في النواة والنويات، ويتفاعل مع البروتين p53.^[4] وهو يُعدِّل وظيفة البروتين p53، ويُثبِّط نمو الخلايا في مسار إشارات Ras/Raf.^[3] وقد ثَبُتَ أن IFI16 يلعب دورًا في استشعار الحمض النووي داخل الخلايا^[5] - وهي سمةٌ مُميِّزة للخلايا المُصابة بالفيروسات - كما رُبِطَ بموت الخلايا التائية المساعدة CD4 المُصابة بفيروس نقص المناعة البشرية عن طريق موت الخلايا المُبرمج، وهو شكلٌ التهابيٌّ للغاية من موت الخلايا المُبرمج.^[6]^[7] في الآونة الأخيرة، تم إظهار كيف يمكن لـ IFI16، بمجرد إطلاقه خارج الخلية، أن يسبب الالتهاب عند ارتباطه بـ TLR4، حيث يعمل كنمط جزيئي مرتبط بالضرر.^[8]

المراجع

↑ Trapani JA، Dawson M، Apostolidis VA، Browne KA (ديسمبر 1994). "Genomic organization of IFI16, an interferon-inducible gene whose expression is associated with human myeloid cell differentiation: correlation of predicted protein domains with exon organization". Immunogenetics. ج. 40 ع. 6: 415–24. DOI:10.1007/bf00177824. PMID:7959953.
↑ "Entrez Gene: IFI16 interferon, gamma-inducible protein 16". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
1 2 Trapani JA، Browne KA، Dawson MJ، Ramsay RG، Eddy RL، Show TB، White PC، Dupont B (أكتوبر 1992). "A novel gene constitutively expressed in human lymphoid cells is inducible with interferon-gamma in myeloid cells". Immunogenetics. ج. 36 ع. 6: 369–76. DOI:10.1007/bf00218044. PMID:1526658.
↑ Ouchi M، Ouchi T (يناير 2008). "Role of IFI16 in DNA damage and checkpoint". Frontiers in Bioscience. ج. 13 ع. 13: 236–239. DOI:10.2741/2673. PMID:17981541.
↑ Unterholzner L، Keating SE، Baran M، Horan KA، Jensen SB، Sharma S، Sirois CM، Jin T، Latz E، Xiao TS، Fitzgerald KA، Paludan SR، Bowie AG (نوفمبر 2010). "IFI16 is an innate immune sensor for intracellular DNA". Nature Immunology. ج. 11 ع. 11: 997–1004. DOI:10.1038/ni.1932. PMC:3142795. PMID:20890285.
↑ Monroe KM، Yang Z، Johnson JR، Geng X، Doitsh G، Krogan NJ، Greene WC (يناير 2014). "IFI16 DNA sensor is required for death of lymphoid CD4 T cells abortively infected with HIV". Science. ج. 343 ع. 6169: 428–432. Bibcode:2014Sci...343..428M. DOI:10.1126/science.1243640. PMC:3976200. PMID:24356113.
↑ Doitsh G، Galloway NL، Geng X، Yang Z، Monroe KM، Zepeda O، Hunt PW، Hatano H، Sowinski S، Muñoz-Arias I، Greene WC (يناير 2014). "Cell death by pyroptosis drives CD4 T-cell depletion in HIV-1 infection". Nature. ج. 505 ع. 7484: 509–514. Bibcode:2014Natur.505..509D. DOI:10.1038/nature12940. PMC:4047036. PMID:24356306.
↑ Iannucci A, Caneparo V, Raviola S, Debernardi I, Colangelo D, et al. (2020) Toll-like receptor 4-mediated inflammation triggered by extracellular IFI16 is enhanced by lipopolysaccharide binding. PLOS Pathogens 16(9): e1008811. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008811

قراءة متعمقة

Dawson MJ، Trapani JA (1995). "IFI 16 gene encodes a nuclear protein whose expression is induced by interferons in human myeloid leukaemia cell lines". J. Cell. Biochem. ج. 57 ع. 1: 39–51. DOI:10.1002/jcb.240570106. PMID:7536752.
Dawson MJ، Trapani JA، Briggs RC، وآخرون (1995). "The closely linked genes encoding the myeloid nuclear differentiation antigen (MNDA) and IFI16 exhibit contrasting haemopoietic expression". Immunogenetics. ج. 41 ع. 1: 40–3. DOI:10.1007/BF00188431. PMID:7806273.
Johnstone RW، Kerry JA، Trapani JA (1998). "The human interferon-inducible protein, IFI 16, is a repressor of transcription". J. Biol. Chem. ج. 273 ع. 27: 17172–7. DOI:10.1074/jbc.273.27.17172. PMID:9642285.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Johnstone RW، Kershaw MH، Trapani JA (1998). "Isotypic variants of the interferon-inducible transcriptional repressor IFI 16 arise through differential mRNA splicing". Biochemistry. ج. 37 ع. 34: 11924–31. DOI:10.1021/bi981069a. PMID:9718316.
Dawson MJ، Elwood NJ، Johnstone RW، Trapani JA (1998). "The IFN-inducible nucleoprotein IFI 16 is expressed in cells of the monocyte lineage, but is rapidly and markedly down-regulated in other myeloid precursor populations". J. Leukoc. Biol. ج. 64 ع. 4: 546–54. PMID:9766636.
Briggs LJ، Johnstone RW، Elliot RM، وآخرون (2001). "Novel properties of the protein kinase CK2-site-regulated nuclear- localization sequence of the interferon-induced nuclear factor IFI 16". Biochem. J. ج. 353 ع. Pt 1: 69–77. DOI:10.1042/0264-6021:3530069. PMC:1221544. PMID:11115400.
Johnstone RW، Wei W، Greenway A، Trapani JA (2001). "Functional interaction between p53 and the interferon-inducible nucleoprotein IFI 16". Oncogene. ج. 19 ع. 52: 6033–42. DOI:10.1038/sj.onc.1204005. PMID:11146555.
Gariglio M، Azzimonti B، Pagano M، وآخرون (2003). "Immunohistochemical expression analysis of the human interferon-inducible gene IFI16, a member of the HIN200 family, not restricted to hematopoietic cells". J. Interferon Cytokine Res. ج. 22 ع. 7: 815–21. DOI:10.1089/107999002320271413. PMID:12184920.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
Izmailova E، Bertley FM، Huang Q، وآخرون (2003). "HIV-1 Tat reprograms immature dendritic cells to express chemoattractants for activated T cells and macrophages". Nat. Med. ج. 9 ع. 2: 191–7. DOI:10.1038/nm822. PMID:12539042.
Clarke CJ، Apostolidis V، Hii LL، وآخرون (2003). "Critical role of the transcription factor AP-1 for the constitutive and interferon-induced expression of IFI 16". J. Cell. Biochem. ج. 89 ع. 1: 80–93. DOI:10.1002/jcb.10475. PMID:12682910.
Xin H، Curry J، Johnstone RW، وآخرون (2003). "Role of IFI 16, a member of the interferon-inducible p200-protein family, in prostate epithelial cellular senescence". Oncogene. ج. 22 ع. 31: 4831–40. DOI:10.1038/sj.onc.1206754. PMID:12894224.
Kwak JC، Ongusaha PP، Ouchi T، Lee SW (2003). "IFI16 as a negative regulator in the regulation of p53 and p21(Waf1)". J. Biol. Chem. ج. 278 ع. 42: 40899–904. DOI:10.1074/jbc.M308012200. PMID:12925527.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Aglipay JA، Lee SW، Okada S، وآخرون (2004). "A member of the Pyrin family, IFI16, is a novel BRCA1-associated protein involved in the p53-mediated apoptosis pathway". Oncogene. ج. 22 ع. 55: 8931–8. DOI:10.1038/sj.onc.1207057. PMID:14654789.
Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
Raffaella R، Gioia D، De Andrea M، وآخرون (2004). "The interferon-inducible IFI16 gene inhibits tube morphogenesis and proliferation of primary, but not HPV16 E6/E7-immortalized human endothelial cells". Exp. Cell Res. ج. 293 ع. 2: 331–45. DOI:10.1016/j.yexcr.2003.10.014. PMID:14729471.
Fujiuchi N، Aglipay JA، Ohtsuka T، وآخرون (2004). "Requirement of IFI16 for the maximal activation of p53 induced by ionizing radiation". J. Biol. Chem. ج. 279 ع. 19: 20339–44. DOI:10.1074/jbc.M400344200. PMID:14990579.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Beausoleil SA، Jedrychowski M، Schwartz D، وآخرون (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 101 ع. 33: 12130–5. DOI:10.1073/pnas.0404720101. PMC:514446. PMID:15302935.

[pmid7959953-1] Trapani JA، Dawson M، Apostolidis VA، Browne KA (ديسمبر 1994). "Genomic organization of IFI16, an interferon-inducible gene whose expression is associated with human myeloid cell differentiation: correlation of predicted protein domains with exon organization". Immunogenetics. ج. 40 ع. 6: 415–24. DOI:10.1007/bf00177824. PMID:7959953.

[entrez-2] "Entrez Gene: IFI16 interferon, gamma-inducible protein 16". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[pmid1526658-3] 1 2 Trapani JA، Browne KA، Dawson MJ، Ramsay RG، Eddy RL، Show TB، White PC، Dupont B (أكتوبر 1992). "A novel gene constitutively expressed in human lymphoid cells is inducible with interferon-gamma in myeloid cells". Immunogenetics. ج. 36 ع. 6: 369–76. DOI:10.1007/bf00218044. PMID:1526658.

[4] Ouchi M، Ouchi T (يناير 2008). "Role of IFI16 in DNA damage and checkpoint". Frontiers in Bioscience. ج. 13 ع. 13: 236–239. DOI:10.2741/2673. PMID:17981541.

[pmid20890285-5] Unterholzner L، Keating SE، Baran M، Horan KA، Jensen SB، Sharma S، Sirois CM، Jin T، Latz E، Xiao TS، Fitzgerald KA، Paludan SR، Bowie AG (نوفمبر 2010). "IFI16 is an innate immune sensor for intracellular DNA". Nature Immunology. ج. 11 ع. 11: 997–1004. DOI:10.1038/ni.1932. PMC:3142795. PMID:20890285.

[pmid24356113-6] Monroe KM، Yang Z، Johnson JR، Geng X، Doitsh G، Krogan NJ، Greene WC (يناير 2014). "IFI16 DNA sensor is required for death of lymphoid CD4 T cells abortively infected with HIV". Science. ج. 343 ع. 6169: 428–432. Bibcode:2014Sci...343..428M. DOI:10.1126/science.1243640. PMC:3976200. PMID:24356113.

[pmid24356306-7] Doitsh G، Galloway NL، Geng X، Yang Z، Monroe KM، Zepeda O، Hunt PW، Hatano H، Sowinski S، Muñoz-Arias I، Greene WC (يناير 2014). "Cell death by pyroptosis drives CD4 T-cell depletion in HIV-1 infection". Nature. ج. 505 ع. 7484: 509–514. Bibcode:2014Natur.505..509D. DOI:10.1038/nature12940. PMC:4047036. PMID:24356306.

[8] Iannucci A, Caneparo V, Raviola S, Debernardi I, Colangelo D, et al. (2020) Toll-like receptor 4-mediated inflammation triggered by extracellular IFI16 is enhanced by lipopolysaccharide binding. PLOS Pathogens 16(9): e1008811. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008811

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 147586
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000566111 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1415886