عامل تنشيط البروتياز الاستماتي الأول

APAF1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
معرفات
أسماء بديلة APAF1, APAF-1, CED4, apoptotic peptidase activating factor 1
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 602233 MGI: MGI:1306796 HomoloGene: 7626 GeneCards: 317
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي




المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 317 11783
Ensembl ENSG00000120868 ENSMUSG00000019979
يونيبروت

O14727

O88879

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_013229، ‏NM_181861، ‏NM_181868، ‏NM_181869، ‏XM_017019250، ‏XM_047428758، ‏XM_047428759، ‏XM_047428760 NM_001160، ‏NM_013229، ‏NM_181861، ‏NM_181868، ‏NM_181869، ‏XM_017019250، ‏XM_047428758، ‏XM_047428759، ‏XM_047428760

‏NM_001282947، ‏NM_009684 NM_001042558، ‏NM_001282947، ‏NM_009684

RefSeq (بروتين)

‏NP_037361، ‏NP_863651، ‏NP_863658، ‏NP_863659، ‏XP_016874739 NP_001151، ‏NP_037361، ‏NP_863651، ‏NP_863658، ‏NP_863659، ‏XP_016874739

‏NP_001269876، ‏NP_033814، ‏XP_036011453، ‏XP_036011454، ‏XP_036011455 NP_001036023، ‏NP_001269876، ‏NP_033814، ‏XP_036011453، ‏XP_036011454، ‏XP_036011455

الموقع (UCSC n/a Chr 10: 90.99 – 91.08 Mb
بحث ببمد
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر
عامل تنشيط البروتياز الاستماتي الأول
معلومات عامة
جزء من
  القائمة ...
WD40/YVTN repeat-like-containing domain superfamily [الإنجليزية] ترجم[1]
Apoptotic protease-activating factor 1 [الإنجليزية] ترجم[1]
P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase [الإنجليزية] ترجم[1]
WD40-repeat-containing domain superfamily [الإنجليزية] ترجم[1]
Winged helix-like DNA-binding domain superfamily [الإنجليزية] ترجم[1]
Death-like domain superfamily [الإنجليزية] ترجم[1]
Apoptotic Protease-Activating Factor 1, CARD domain, protein family [الإنجليزية] ترجم
CARD domain, protein family [الإنجليزية] ترجم
NB-ARC domain, protein family [الإنجليزية] ترجم
WD40 repeat, protein family [الإنجليزية] ترجم
WD40 repeat, conserved site, protein family [الإنجليزية] ترجم
G-protein beta WD-40 repeat, protein family [الإنجليزية] ترجم عدل القيمة على Wikidata
وُجد في الأصنوفة
يشفر بـ
عامل تنشيط البروتياز الاستماتي الأول [لغات أخرى][2] عدل القيمة على Wikidata
الوظيفة الجزيئية
  القائمة ...
heat shock protein binding [الإنجليزية] ترجم[3]
ADP binding [الإنجليزية] ترجم[4]
ربط بروتيني[5][6][7]
identical protein binding [الإنجليزية] ترجم[3]
ATP binding [الإنجليزية] ترجم[8]
nucleotide binding [الإنجليزية] ترجم[9][8]
cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process [الإنجليزية] ترجم[10][11][3] عدل القيمة على Wikidata
مكون الخلية
العملية الحيوية
  القائمة ...
cellular response to transforming growth factor beta stimulus [الإنجليزية] ترجم[3]
neuron apoptotic process [الإنجليزية] ترجم[3]
regulation of apoptotic process [الإنجليزية] ترجم[22][18][4]
تمايز خلوي[3]
response to hypoxia [الإنجليزية] ترجم[3]
response to nutrient [الإنجليزية] ترجم[3]
response to G1 DNA damage checkpoint signaling [الإنجليزية] ترجم[20]
شيخوخة[3]
positive regulation of apoptotic signaling pathway [الإنجليزية] ترجم[3]
glial cell apoptotic process [الإنجليزية] ترجم[14]
نماء عصبي[23]
نمو متعدد الخلايا [لغات أخرى][3] عدل القيمة على Wikidata
له جزء أو أجزاء
  القائمة ...
تكرارية W-D الأربعينية[1]
G-protein beta WD-40 repeat [الإنجليزية] ترجم[1]
NB-ARC [الإنجليزية] ترجم[1]
CARD domain [الإنجليزية] ترجم[1]
WD40 repeat, conserved site [الإنجليزية] ترجم[1]
Apoptotic Protease-Activating Factor 1, CARD domain [الإنجليزية] ترجم[1] عدل القيمة على Wikidata

عامل تنشيط البروتياز الاستماتي الأول، أو APAF1[ا] اختصارًا، هو نظير بشري لمورثة CED-4[ب] عند الربداء رشيقة.[24][25][26]

الوظيفة

تُعُرِّفَ على البروتين في مختبر شياو دونغ وانغ على أنه منشِّطٌ للكاسبيز الثالث بحضور السيتوكروم C والـdATP.[27] هذه المورثة ترمز لبروتين جِبِلِّي يشكل أحد أهم المحطات في شبكة الضبط الاستماتي. هذا البروتين يحوي (بدءًا من الطرف N) على نطاق تجنيد كاسبيز (CARD)، على نطاق ATPase (NB-ARC)، بضع نِطاقات لولبية وعدد من تكراريات W-D الأربعينية. عند ارتباطه بالسيتوكروم C والـdATP، يُكوِّن هذا البروتين جسيمًا استماتيًّا قليل القسيمات. الجسيم الاستماتي يرتبط بالبروكاسبيز التاسع، محرِّرًا هيئته الناضجة النشطة. آلية هذا التفاعل الدقيقة مازالت محل جدال، إلا أن غي سالفيسن يقترح عبر عمله المنشور أن الجسيم الاستماتي قد يتسبب في تثني الكاسبيز التاسع وبالتالي تحفُّزه الذاتي.[28] الكاسبيز التاسع النشط يبدِئ مسلسل الكاسبيز الذي يدفع الخلية إلى الاستماتة.

التضفير البديل يتسبب في تكوين عدة نسخ متغايرة ترمز لنظائر مختلفة.

البنية

يحتوي APAF1 على نطاق تجنيد كاسبيز مع نمط متشابك مكوَّن من ستة لوالب ، نِطاقات طَيَّة روسمان الرابطة للنوكليوتيدات، نمط لولبيٌّ قصير ونطاق لولبيٌّ مجنح.[29]

Apoptosome complex structure

التآثرات

ظهر أن APAF1 يتآثر مع:

المراجع

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 "InterPro Release 71.0". 8 نوفمبر 2018.
  2. 1 2 مذكور في: يونيبروت. الوصول: 13 نوفمبر 2019. معرف يونيبروت: O14727. لغة العمل أو لغة الاسم: الإنجليزية.
  3. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  4. 1 2 3 "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  5. William J Henzel (1 Aug 1997). "Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3" (بالإنجليزية). pp. 405–413. Retrieved 2019-04-08.
  6. "Aven, a novel inhibitor of caspase activation, binds Bcl-xL and Apaf-1" (بالإنجليزية). Jul 2000. pp. 31–40. Retrieved 2019-04-08.
  7. "Integrity of ATP binding site is essential for effective inhibition of the intrinsic apoptosis pathway by NAIP" (بالإنجليزية). 1 Apr 2011. pp. 158–62. Retrieved 2019-04-08.
  8. 1 2 3 "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  9. "A soluble version of the receptor-like protein tyrosine phosphatase kappa stimulates neurite outgrowth via a Grb2/MEK1-dependent signaling cascade" (بالإنجليزية). Jun 1999. pp. 441–9. Retrieved 2019-04-08.
  10. 1 2 William J Henzel (1 Aug 1997). "Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3" (بالإنجليزية). pp. 405–413. Retrieved 2019-04-08.
  11. Pier Giorgio Natali (Feb 2004). "Analysis of APAF-1 expression in human cutaneous melanoma progression" (بالإنجليزية). pp. 93–7. Retrieved 2019-04-08.
  12. "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2017-10-31.
  13. William J Henzel (1 Aug 1997). "Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3" (بالإنجليزية). pp. 405–413. Retrieved 2017-10-31.
  14. 1 2 3 "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2017-10-31.
  15. Trairak Pisitkun (3 Dec 2008). "Large-scale proteomics and phosphoproteomics of urinary exosomes" (بالإنجليزية). pp. 363–379. Retrieved 2017-10-31.
  16. Lorenzo Galluzzi (Jul 2008). "No death without life: vital functions of apoptotic effectors" (بالإنجليزية). pp. 1113–23. Retrieved 2017-10-31.
  17. "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2017-10-31.
  18. 1 2 3 4 5 "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  19. "CARD-8 protein, a new CARD family member that regulates caspase-1 activation and apoptosis" (بالإنجليزية). 30 Jan 2002. pp. 13952–13958. Retrieved 2019-04-08.
  20. 1 2 Lorenzo Galluzzi (Jul 2008). "No death without life: vital functions of apoptotic effectors" (بالإنجليزية). pp. 1113–23. Retrieved 2019-04-08.
  21. Trairak Pisitkun (3 Dec 2008). "Large-scale proteomics and phosphoproteomics of urinary exosomes" (بالإنجليزية). pp. 363–379. Retrieved 2019-04-08.
  22. "Three new types of Apaf-1 in mammalian cells" (بالإنجليزية). 11 Aug 1999. pp. 746–9. Retrieved 2019-04-08.
  23. Gonzalo Alvarez-Bolado (18 Sep 1998). "Apaf1 (CED-4 homolog) regulates programmed cell death in mammalian development" (بالإنجليزية). pp. 727–37. Retrieved 2019-04-08.
  24. "Entrez Gene: APAF1 apoptotic peptidase activating factor 1". مؤرشف من الأصل في 2024-06-22.
  25. Zou H، Henzel WJ، Liu X، Lutschg A، Wang X (أغسطس 1997). "Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3". Cell. ج. 90 ع. 3: 405–13. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80501-2. PMID:9267021. S2CID:18105320.
  26. Kim H، Jung YK، Kwon YK، Park SH (1999). "Assignment of apoptotic protease activating factor-1 gene (APAF1) to human chromosome band 12q23 by fluorescence in situ hybridization". Cytogenetics and Cell Genetics. ج. 87 ع. 3–4: 252–3. DOI:10.1159/000015436. PMID:10702682. S2CID:10377371.
  27. Li P، Nijhawan D، Budihardjo I، Srinivasula SM، Ahmad M، Alnemri ES، Wang X (نوفمبر 1997). "Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade". Cell. ج. 91 ع. 4: 479–89. DOI:10.1016/s0092-8674(00)80434-1. PMID:9390557. S2CID:14321446.
  28. Pop C، Timmer J، Sperandio S، Salvesen GS (أبريل 2006). "The apoptosome activates caspase-9 by dimerization". Molecular Cell. ج. 22 ع. 2: 269–75. DOI:10.1016/j.molcel.2006.03.009. PMID:16630894.
  29. Riedl SJ، Li W، Chao Y، Schwarzenbacher R، Shi Y (أبريل 2005). "Structure of the apoptotic protease-activating factor 1 bound to ADP". Nature. ج. 434 ع. 7035: 926–33. Bibcode:2005Natur.434..926R. DOI:10.1038/nature03465. PMID:15829969. S2CID:4355459.
  30. 1 2 Cho DH، Hong YM، Lee HJ، Woo HN، Pyo JO، Mak TW، Jung YK (سبتمبر 2004). "Induced inhibition of ischemic/hypoxic injury by APIP, a novel Apaf-1-interacting protein". The Journal of Biological Chemistry. ج. 279 ع. 38: 39942–50. DOI:10.1074/jbc.M405747200. PMID:15262985.
  31. 1 2 Hu Y، Benedict MA، Wu D، Inohara N، Núñez G (أبريل 1998). "Bcl-XL interacts with Apaf-1 and inhibits Apaf-1-dependent caspase-9 activation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 95 ع. 8: 4386–91. Bibcode:1998PNAS...95.4386H. DOI:10.1073/pnas.95.8.4386. PMC:22498. PMID:9539746.
  32. 1 2 Pan G، O'Rourke K، Dixit VM (مارس 1998). "Caspase-9, Bcl-XL, and Apaf-1 form a ternary complex". The Journal of Biological Chemistry. ج. 273 ع. 10: 5841–5. DOI:10.1074/jbc.273.10.5841. PMID:9488720.
  33. 1 2 Chu ZL، Pio F، Xie Z، Welsh K، Krajewska M، Krajewski S، Godzik A، Reed JC (مارس 2001). "A novel enhancer of the Apaf1 apoptosome involved in cytochrome c-dependent caspase activation and apoptosis". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 12: 9239–45. DOI:10.1074/jbc.M006309200. PMID:11113115.
  34. Li P، Nijhawan D، Budihardjo I، Srinivasula SM، Ahmad M، Alnemri ES، Wang X (نوفمبر 1997). "Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade". Cell. ج. 91 ع. 4: 479–89. DOI:10.1016/s0092-8674(00)80434-1. PMID:9390557. S2CID:14321446.
  35. Saleh A، Srinivasula SM، Balkir L، Robbins PD، Alnemri ES (أغسطس 2000). "Negative regulation of the Apaf-1 apoptosome by Hsp70". Nature Cell Biology. ج. 2 ع. 8: 476–83. DOI:10.1038/35019510. PMID:10934467. S2CID:20374981.
    1. اختصار لـApoptotic protease activating factor 1
    2. بروتين الموت الخلوي، اختصار لـ Cell death protein 4

    للاستزادة